【水产养殖】浅析肠道菌群对草鱼个体大小的影响 / 草鱼肠道以及水体和底泥菌群的DGGE指纹图谱
草鱼肠道以及水体和底泥菌群的DGGE指纹图谱
对大个体草鱼和小个体草鱼肠道的内容物和黏膜微生物以及水体和底泥微生物的16S rDNA V6~V8可变区片段进行PCR扩增,构建了菌群多样性DGGE指纹图谱,结果见图1。
由DGGE指纹图谱可以看出,除了在每个泳道中均存在的1个条带之外,各样品泳道呈现不同条带,表现出菌群组成的差异(图1A)。

注:W.水体;S.底泥;BM.大个体草鱼的肠道黏膜;SM.小个体草鱼的肠道黏膜;BC.大个体草鱼的肠道内容物;SC.小个体草鱼的肠道内容物。各泳道条带侧方标识代表切胶条带
图1 各样品菌群的DGGE电泳结果(A)以及UPGMA 聚类分析(B)和PCA分析(C)