病原血清较多

有些病原有多种血清型，会存在不能提供交叉保护的情况，如果注射的疫苗与当地流行的毒株不一致，往往免疫效果就不会理想。因此在接种疫苗时，当根据当地疫情流行情况，选择对应的血清型疫苗。

也会存在病毒发生变异，出现新的毒株，疫苗对新的毒株不敏感，也是会引起免疫失败。